Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms