Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cstf3Q99LI7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cstf3Q99LI7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms