Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp16Q99LG0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms