Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nmd3Q99L48 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms