Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me2Q99KE1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me2Q99KE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms