Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlgn1Q99K10 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlgn1Q99K10 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms