Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlcd1Q99JT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms