Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krcc1Q99JT5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krcc1Q99JT5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms