Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apobec3Q99J72 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apobec3Q99J72 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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