Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf112Q96DY5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf112Q96DY5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms