Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc8b1Q925Q3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc8b1Q925Q3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc8b1Q925Q3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms