Protein–RNA interactions for Protein: Q924Z5

Tram2, Translocating chain-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tram2Q924Z5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tram2Q924Z5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms