Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clip1Q922J3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms