Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpe65Q91ZQ5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms