Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf6Q91YR7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms