Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms