Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx15Q91WE1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx15Q91WE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms