Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms