Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApofQ91V80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms