Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf130Q8VEM1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf130Q8VEM1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms