Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk4Q8VEJ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms