Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc115Q8VE99 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc115Q8VE99 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc115Q8VE99 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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