Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
Cul7Q8VE73 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul7Q8VE73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms