Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TgdsQ8VDR7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms