Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fyco1Q8VDC1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fyco1Q8VDC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fyco1Q8VDC1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms