Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms