Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc28Q8VCE1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms