Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med17Q8VCD5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med17Q8VCD5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms