Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RttnQ8R4Y8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RttnQ8R4Y8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms