Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc58Q8R3Q6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc58Q8R3Q6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc58Q8R3Q6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc58Q8R3Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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