Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8R3C1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms