Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim29Q8R2Q0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms