Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r212Q8R268 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r212Q8R268 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms