Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngr3Q8R191 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngr3Q8R191 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms