Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OptnQ8K3K8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms