Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MyripQ8K3I4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MyripQ8K3I4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms