Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms