Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms