Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd3Q8K2F0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms