Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Fcho1Q8K285 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Fcho1Q8K285 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Fcho1Q8K285 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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