Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sde2Q8K1J5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sde2Q8K1J5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms