Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alkbh3Q8K1E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh3Q8K1E6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms