Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FgbQ8K0E8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FgbQ8K0E8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms