Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl3Q8CJC5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl3Q8CJC5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Neurl3Q8CJC5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neurl3Q8CJC5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms