Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip10Q8CJ53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms