Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LgsnQ8CIX8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms