Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Card11Q8CIS0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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Card11Q8CIS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Card11Q8CIS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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