Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp10Q8CIE4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms