Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cog3Q8CI04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cog3Q8CI04 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms