Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mterf1aQ8CHZ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms